Во-первых, не фашистской, а расистской, националистической и ксенофобской (все вместе или на выбор).
А, во-вторых, игрок сам решает как поступить в отношении цербера. Так что, если Вы пошли по пути предательства, то это не пиндосы так героев представляют, а вы сами
И потом, Призрак ведь сразу сказал Шеппарду, что он/она спасен/спасена в целях защиты человеческой расы от новой угрозы. Фактически, они заключили договор: Шеппард расследует нападения на колонии (и, соответственно, спасает человечество), а цербер представляет все необходимое для помощи в этом. О том, что, к примеру, Шеппард должен/должна воспользоваться мегаоружием, которое получает в конце, договора не было, поэтому герой без зазрения совести мог распорядиться им ка кхочет.