Ну цвет у них был умеренно-розовый, поэтому они с правыми эсерами найдут общий язык, а с Колчаком - нет. Впрочем не это главное. На мой взгляд дело было так:
0) Чехословаки к 17-му году были одним из самых боеспособных соединений на восточном фронте ПМВ, тк не только умели воевать, но еще и знали, за что воюют - за независимость своей родины
1) После Брестского мира ЧСК мгновенно превратился в незаконные вооруженное формирование. Более того, по его условиям все военнопленные австро-венгры (к которым они формально относились) должны быть возвращены. И подозрение, что большевики, опасавшиеся немцев до последнего, проделают это и с ними, чехов никогда не покидало
2) Если большевики были бы рады как можно скорее избавиться от инородной вооруженной силы на своей территории, то остальные заинтересованные силы - нет. Германии не улыбалось получить вражеское подкрепление на Западном фронте. Антанте еще один корпус был не особо нужен, интереснее было держать его в качестве ножа у русской спины. Поэтому они тормозили эвакуацию ЧСК. В итоге тот растянулся опасным бикфоровым шнуром от Волги до Дальнего Востока
3) Все это привело к тому, что чехи начали себя ощущать в кольце врагов, держать оружие наготове и реагировать на раздражители нервно. А раздражитель тут же проявился - проходящие в обратном направлении эшелоны пленных венгров. И славяно-венгерская национальная рознь, о которой так уморительно был читать у Гашека, стала той искрой, от которой занялся страшный пожар.
В общем, большевики реально недооценили опасность ситуации