Текстур, отвечающих за небо, в игре целая куча. Просто заходите в папку textures и делаете поиск по запросу "skybox". Для проверки, кстати говоря, можно еще и натив запустить - проверить есть ли в нем какие-нибудь баги с небом, ибо если есть, то проблема, вероятно, связана с модификацией оригинальных ресурсов игры.