По сути, все, кто хотел слезть с флеша, уже сделали это. Во многих браузерах он по умолчанию даже не загружается уже, а поэтому проблемы будут только у старых сайтов с допотопмными флеш плеерами (даже на Всадниках уже ролики через HTML5 вызываются). Насчет работы с анимацией не знаю, но там вроде тоже уже свои альтернативы давно есть, к тому же Adobe по-моему работу над редактором свернул еще раньше, чем над плеером.